總 期 數:52 期
辦 學 歷 史:16 年(2002 年-2017 年)
開 班 時 間:2017 年 8 月 18 日-8 月 25 日(18 日為全天報到日,19 日開始上課)
上 課 地 點:杭州 浙江大學華家池校區(qū)
隨著眾多生物基因組測序項目的完成,生物學數據正在加速度增長。如何科學地分析和注釋這些高通量數據,已成為生物學工作者急需學習和解決的問題。
浙江大學「基因組科學」研習班邀請北京基因組所于軍教授、胡松年教授為您講授基因組學基礎知識和前沿進展、基因轉錄組的測定及分析、二代測序等實驗技術的關鍵事項;浙江大學楊軍教授、陳銘教授等講解系統生物學及高通量分析研究方法和思路。
浙江大學基因組科學研習班多次獲得浙江大學優(yōu)秀項目創(chuàng)新獎,目前已舉辦 51 期,學員來自全國 30 余個省市,累計培訓學員 5100 余名。每次研習班不乏教授、博導參加,更受到博士后、碩博生等年輕學者的青睞。
他們中有一些帶著課題或問題前來交流和聯系,不少學員通過本研習班建立了長期協作關系,共同申請國家 973、863 課題,共同發(fā)表論文,其中不少優(yōu)秀的研究成果,已在 SCI 期刊上發(fā)表。
一、浙江大學基因組科學研習班上課內容
上課內容涵蓋「基因組學—蛋白質組學—系統生物學」的研究方法、技術思路、前沿進展及其在各生物學科中的應用。
浙江大學基因組科學研習班核心課程包括:
1. 基因組的比較研究、DNA 測序技術原理與進展(講課人:于 軍 教授)
2. 轉錄組的測定與分析、大規(guī)模測序方法及應用、微生物基因組學、基因組學與精準醫(yī)學(講課人:胡松年教授)
3. 系統生物學建模分析及高通量分析技術應用(講課人:楊軍、陳銘教授等)
4. 蛋白質組學概論及應用(講課人:鐘伯雄教授)
二、浙江大學基因組科學研習班上機內容
上機實習課采用 「跟我學」方式,學習實踐各類基礎生物信息學軟件,每人一臺 PC 機跟著大屏幕一步步學會基因組、蛋白質組學數據分析的基本方法。
浙江大學基因組科學研習班主要內容如下:
實習一: 基因組數據注釋和功能分析
通過序列比對工具 BLAST 的學習,了解基因功能注釋的原理;介紹多序列聯配工具 ClustalX 及分子進化分析軟件 MEGA4,掌握系統發(fā)生樹繪制的基本方法,認識基因復制在進化上的功能;學習基因序列分析常用的數據庫和軟件。
實習二: 轉錄組數據分析
介紹轉錄組數據分析的基本流程及其原理;通過對 tophat、cufflinks、R 等轉錄組數據分析工具的介紹及演示,了解基于二代測序數據的轉錄組分析流程及常用分析方法; 利用 kegg、GOstat、DAVID 等在線工具挖掘轉錄組數據的生物學意義。
實習三:系統生物學軟件實習-----網絡結構顯示與分析
利用 Cytoscape 系統生物學分析軟件,分析蛋白-蛋白相互作用,展示分子網絡系統,并與基因表達等數據整合。
實習四:蛋白質結構與功能分析
從數據庫搜索感興趣的蛋白質氨基酸序列開始,接著對蛋白質基本理化性質、二級結構、和三維空間結構和序列模體進行分析,預測目標蛋白的生物功能。
實習五: 蛋白質組質譜分析
使用 X!Tandem、Mascot、Sequest 等軟件鑒定蛋白質質譜數據,將質譜結果匹配到蛋白質組數據庫鑒定蛋白;使用 TPP 軟件包進行統計學分析和優(yōu)化檢索結果練習。
三、浙江大學基因組科學研習班培訓對象
1. 無生物信息學背景,希望了解生物信息學的學員;
2. 計劃開展各類組學研究的科研人員;
3. 已有組學數據需了解分析方法的研究人員;
4. 有志從事生物信息學相關工作的學生或者技術人員。
四、浙江大學基因組科學研習班報名方法
若有參加意向,請直接將回執(zhí)發(fā)至 genetrain@zju.edu.cn,我們會即刻回函并在浙江大學繼續(xù)教育系統錄入,待排定課表后發(fā)給您詳細課程表。待您再次確認后,發(fā)給您報到通知并排定上機號。培訓結束,發(fā)放浙江大學繼續(xù)教育證書。(尚有少量名額,請盡快報名)
五、浙江大學基因組科學研習班教材 "DNA 和蛋白質序列數據分析工具」(第三版), 薛慶中等編著,科學出版社出版 2012 年 6 月發(fā)行。會務組提供。
聯系方式???? ?聯 系 人:代成林 18757558672?
電話:0571-88206579
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